Arbeitszeitcontrolling wird nicht primär verstanden als Kontrolle von Arbeitszeit, sondern vorrangig als Planung und Steuerung von Arbeitszeit.
Es geht dabei darum, dass sich Arbeitnehmervertretung und Geschäftsführung (möglichst schriftlich, z. B. über eine Hinweismappe oder ein Arbeitszeit-Handbuch) auf Verfahren, Wege und Kommunikationsformen verständigen, nach denen alle Beteiligten im Betrieb sich im Umgang mit flexiblen Arbeitszeiten austauschen, Erfahrungen auswerten und gemeinsam nach Wegen zur kontinuierlichen Verbesserung der Arbeitszeitpraxis suchen.